1600年參加關原之戰,隨主君忠興參加會津征伐。戰後忠興轉封
豐前國、
豐後國成為39萬石大名,父康之亦受封豐後國杵築城2萬5千石,相當於大名的級別。
1611年父親康之隱居後繼承家督。1632年細川氏移封
肥後國熊本藩,興長亦受封玉名、合志郡3萬石領地。
1637年島原之亂中受主君
細川忠利之命往返奔走於幕府及他藩之間,同時還率3700人的軍隊參戰。
1645年,於八代城隱居的細川忠興去世,此後興長成為八代城主。忠興第六子(松井寄之)還成為興長養嗣子。
1661年興長去世,松井家以細川氏同族身份長期任筆頭家老職務直至
明治維新。