昌吉國醫館位於昌吉市延安北路339號(昌吉州人民醫院北側)，區位優勢適中，交通便捷。國醫館大樓分為三層，總面積約3000平方米，一樓設掛號收費室、中藥配方室、西藥配方室、中藥煎煮室、中藥儲藏室、健康營養餐廳等，二樓、三樓設中醫內科、中醫婦科、中醫兒科、中醫外科、中醫骨傷科、中醫針灸科、中醫推拿科、B超室、醫學檢驗科等共30間門診室，可容納800餘人同時候診，最高日門診量可達2500人次以上。
