日本陸軍三總長制，日本帝國主義陸軍最高軍事指揮機關的組織職能制度。日本帝國主義自創立陸軍以來，建立了不同於有些國家的軍事最高指揮機關。其陸軍省是軍政機關(類似國防部，但不包括海軍)，是政府機構，主管政府的國防政策、部隊動員、國防預算、後勤供應、武器研製生產、軍官任命等。其參謀本部是指揮用兵機關，隸屬於天皇，不受政府管轄，輔佐天皇指揮陸軍，在有關軍政方針等方面問題接受陸軍大臣的指導，平時負責情報收集，戰略戰役計畫，部隊調動，作戰指揮及管理陸軍大學。戰時作戰命令，必須由參謀總長代表天皇下達。日本陸軍訓練總監部負責管理陸軍幼年學校、預科學校、士官學校及各兵種學校。因這三個部門都有相當的權力，故日本陸軍通常稱其陸軍大臣、陸軍參謀總長、陸軍訓練總監為日本陸軍的“三總長”。由於這種體制，日軍在多次軍事作戰中因令出多頭而產生矛盾。
