施紹萍

施紹萍,女,博士,南昌大學理學院副教授,碩士研究生導師。

基本介紹

  • 中文名:施紹萍
  • 學位/學歷:博士
  • 職業:教師
  • 專業方向:多目標規劃,蛋白質結構與功能理論預測、信息挖掘
  • 任職院校:南昌大學理學院
個人經歷,研究方向,學術成果,

個人經歷

1996年7月南昌大學數學專業本科畢業;2002年7月南昌大學套用數學碩士研究生畢業,同年留校任教;2012年7月南昌大學生物信息學博士研究生畢業,獲博士學位。
社會兼職:
擔任BMC Genomics、PLoS ONE、Genomics, Proteomics & Bioinformatics等國際知名期刊審稿人。

研究方向

多目標規劃蛋白質結構與功能理論預測、信息挖掘、網路分析等生物信息學

學術成果

近年來,主持完成國家自然科學青年基金和江西省自然科學基金各1項,主持在研國家自然科學地區基金1項。在多目標規劃和生物信息學方面取得了較好的研究成果,構建了一系列蛋白質結構、功能的預測模型,並同步開發了線上預測分析服務平台。在國內數學權威核心期刊《套用數學學報》和國際重要學術期刊 BBA-Molecular Cell Research、Bioinformatics、Journal of Molecular Graphics and Modelling、Journal of Chemical Information and Modeling、Journal of Theoretical Biology等發表SCI論文20餘篇。
近五年承擔科研項目:
1. 國家自然科學基金地區項目:甲基轉移酶特異蛋白甲基化識別及其調控網路生物信息挖掘(21665016),40萬,2017.1-2020.12,主持,在研。
2. 國家自然科學基金青年項目:胺基酸突變對賴氨酸翻譯後修飾影響的生物信息學研究(21305062),25萬,2014.1-2016.12,主持,已結題。
3.江西省自然科學基金項目:亞細胞定位功能預測及線上共享平台創建研究(20151BAB203022),5萬,2015.1-2017.12,主持,已結題。
近五年代表性論文:
1. Lina Wang, Shaoping Shi, Pingping Wen, Zhiyou Zhou, Jianding Qiu*. Computing prediction and functional analysis of prokaryotic propionylation, Journal of Chemical Information and Modeling,
2.Lina Wang, Shaoping Shi, Haodong Xu, Pingping Wen, Jianding Qiu*. Computational prediction of species-specific malonylation sites via enhanced characteristic strategy, Bioinformatics,
3. PingpingWen, Shaoping Shi, Haodong Xu, Lina Wang, Jianding Qiu*. Accurate in silico prediction of species-specific methylation sites based on information gain feature optimization, Bioinformatics
4. Xiang Chen, Shaoping Shi, Haodong Xu, Shengbao Suo, Jianding Qiu*. A homology-based pipeline for global prediction of post-translational modification sites, Scientific Reports
5.Shaoping Shi, Haodong Xu, Pingping Wen, Jianding Qiu*, Progress and challenges in predicting protein methylation sites, Molecular BioSystems
6.Shaoping Shi, Xiang Chen, Haodong Xu, Jianding Qiu*, PredHydroxy: Computational prediction of protein hydroxylation site locations based on the primary structure, Molecular BioSystems,
7. Shaoping Shi, Xingyu Sun, Jianding Qiu*, Shengbao Suo, Xiang Chen, Shuyun Huang, Ruping Liang, The prediction of palmitoylation site locations using a multiple feature extraction methods, Journal of Molecular Graphics and Modelling,
8. Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, A method to distinguish between lysine acetylation and lysine methylation from protein sequences, Journal of Theoretical Biology
9. Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, PMeS: Prediction of methylation sites based on enhanced feature encoding scheme, PLoS ONE
10. Shaoping Shi, Jianding Qiu*, Xingyu Sun, Shengbao Suo, Shuyun Huang, Ruping Liang, PLMLA: Prediction of lysine methylation and lysine acetylation by combining multiple features, Molecular BioSystems,

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