施威揚,男,華盛頓大學博士,加州大學伯克利分校博士後,曾任同濟大學生命學院教授。現任中國海洋大學海洋生命學院築峰工程特聘教授。
基本介紹
教育經歷,工作經歷,研究方向,主要學術成果,
教育經歷
1997/08—2003/9 美國華盛頓大學,博士
1993/09—1997/06 清華大學生物科學與技術系,學士
工作經歷
2017/01—至今 中國海洋大學海洋生命學院,築峰工程特聘教授
2012/01—2016/12 同濟大學生命學院,教授
2008/11—2011/09 美國加州大學伯克利分校,Research Specialist
2003/11—2008/10 美國加州大學伯克利分校,博士後
研究方向
課題組主要使用單細胞組學及生物信息學方法,研究海洋生物發育和生長過程中細胞多樣性形成、組織器官分化、免疫調控等過程中基因網路對細胞命運/行為的調控。實驗室研究涵蓋了海鞘、文昌魚、牡蠣、扇貝等多種海洋生物模型。
主要研究課題包括:
1.海洋生物胚胎髮育的單細胞圖譜構建
2.水產養殖生物免疫系統的單細胞組學研究
3.長非編碼RNA的預測與功能研究
主要學術成果
Hendrix, D, Levine, M & Shi, W* miRTRAP, a computational approach to systematically identify miRNAs in the simple chordate Ciona intestinalis. Genome Biology 2010, 11(4):R39
Christiaen, L, Wagner, E, Shi, W & Levine, M. Emerging Model Organisms: The Sea Squirt Ciona intestinalis. Cold Spring Harbor Protocols 2009 (12)
Shi, W., Hendrix, D, Levine, M & Haley, B. A distinct class of small RNA arising from pri-microRNA sequences in a simple chordate. Nature Structural and Molecular Biology 16, 183 - 189 (2009)
Shi, W.*, Peyrot, S., Munro, E. & Levine, M. FGF3 in the floorplate directs notochord convergent extension in the Ciona tadpole. Development 136, 23-28 (2009)
Shi, W. * & Levine, M. Ephrin signaling establishes asymmetric cell fates in an endomesoderm lineage of the Ciona embryo. Development 135, 931-40 (2008)
Beh, J., Shi, W., Levine, M., Davidson, B. & Christiaen, L. FoxF is essential for FGF-induced migration of heart progenitor cells in the ascidian Ciona intestinalis. Development 134, 3297-305 (2007)
Davidson, B., Shi, W., Beh, J., Christiaen, L. & Levine, M. FGF signaling delineates the cardiac progenitor field in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genes Dev 20, 2728-38 (2006)
Shi, W., Levine, M. & Davidson, B. Unraveling genomic regulatory networks in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genome Res 15, 1668-74 (2005)
Davidson, B., Shi, W. & Levine, M. Uncoupling heart cell specification and migration in the simple chordate Ciona intestinalis. Development 132, 4811-8 (2005).