新致病基因DIEXF在唇裂發生中的遺傳效應及作用機制研究

《新致病基因DIEXF在唇裂發生中的遺傳效應及作用機制研究》是依託四川大學，由賈仲林擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：新致病基因DIEXF在唇裂發生中的遺傳效應及作用機制研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：賈仲林
• 依託單位：四川大學

項目摘要

非綜合徵型唇裂（NSCLO）是頜面部最常見的出生缺陷。由於其治療周期長，給家庭和社會帶來沉重負擔，嚴重影響出生人口素質。NSCLO致病機理複雜，當前的研究結果尚不能作為產前診斷和預防的理論依據。需要尋找更具致病作用的基因靶點,並掌握其具體致病機制，為釆取有針對性的防治措施奠定基礎。申請者前期研究發現DIEXF基因與中國漢族人群NSCLO的發生密切相關，但其在NSCLO發生中的遺傳效應和作用機制未知。為此，本項目擬在利用NSCLO家系對DIEXF基因進行測序來篩查遺傳變異，計算其對中國漢族人群NSCLO發生的遺傳效應的基礎上，採用DIEXF基因敲除模型及相關分子生物學技術從細胞、器官不同層面和角度，研究DIEXF基因在唇部及顱面部發育中的作用機制。最終闡明DIEXF基因在唇裂發生中的致病途徑和關鍵靶點，為唇齶裂實現個體化治療的目標提供新的研究手段，為最終實現中國人群唇齶裂精準防治奠定基礎。

結題摘要

非綜合徵型唇裂（NSCLO）是頜面部最常見的出生缺陷，其致病機理複雜。本項目前期從5個唇齶裂全基因組關聯研究、全基因組關聯研究Meta分析及候選基因關聯研究選擇了50個常見SNP位點（分布在14條染色體22個基因上），在440箇中國西部漢族人群非綜合徵型唇齶裂患者-父母核心家系（138個單純唇裂家系，144個單純齶裂家系，158個非綜合徵型唇裂伴齶裂家系）中研究這些位點與中國漢族人群唇齶裂發生的關聯性，研究結果發現了DIEXF（rs12063989）、VAX1、MAFB、FOXE1等基因與中國西部人群NSCLO、NSCL/P的發生密切相關。為了全面、深入地篩查易感位點，本項目進一步採用目標區域測序對DIEXF所在單倍型區域（包含DIEXF基因和IRF6基因）和GWAS報導關聯位點所定位的單倍型區域進行遺傳變異位點篩查，並進行關聯分析和大樣本人群佇列驗證研究，最後結合連鎖分析和logistic回歸分析在IRF6基因內含子區域篩選到了真正的易感位點rs12043599，該位點對中國西部漢族人群NSCLO發生的人群歸因風險百分比是26.43%。這一發現將為中國人群唇齶裂致病機理的研究開闢新的視野。