新疆維吾爾自治區科技興新辦公室是新疆維吾爾自治區直屬事業單位。主要職責：貫徹落實科教興國的方針、政策、法規，擬訂自治區科技興新規劃和政策、法規，組織實施科教興新戰略中的科技興新工作；負責科技興地縣、科技興行業的組織協調工作及考核、評比工作；編制科技興新項目年度計畫，組織實施科技興新項目；組織科技興新培訓、宣傳。
