研究方向與內容
1、新疆特殊環境微生物資源研究，包括新疆特殊環境微生物的分離、鑑定、新產物研發及菌種資源庫的建立。
2、抗逆基因的克隆、表達與調控，包括雪蓮抗寒基因等抗逆基因的克隆與表達及抗逆作物新品種的培育。
3、目的產物的上游及下游技術，包括高效微生物製劑的上下游技術、生產和套用及植物生長調節劑的研究和推廣。
研究成果
“新疆鹽鹼環境放線菌物種與功能多樣性研究”在同類研究中總體達到國際先進水平。“雪蓮抗逆基因的分離、克隆、鑑定及轉抗寒基因棉花的的研究”研究成果總體達到國內先進水平。獲1項國家科技進步二等獎，1項教育部科技進步一等獎，自治區科技進步一等獎及二等獎各1項；申報中國發明專利20項，其中6項獲授權。實驗室近年來發表SCI收錄論文15篇。
研究隊伍
新疆特殊環境微生物實驗室固定科研人員32人，其中博士後1人、博士3人、碩士22人；高級研究人員10人、中級研究人員17人。擁有一支多年從事微生物分類、微生物產物、胺基酸發酵、農業生物製品、分子生物學、細胞生物學、基因工程及生物化工等多學科的科技隊伍。
實驗設施
新疆特殊環境微生物實驗室現有Biolog微生物鑑定系統、蛋白質核酸電泳分析系統和製備系統、超速冷凍離心機、液相色譜儀、PCR擴增儀、核苷酸序列分析系統、數控層析冷櫃、真空冷凍乾燥系統、凝膠成像系統、10L貝朗全自動發酵罐等一批實驗設備，可用於基因工程及發酵工程實驗。具有處於國內先進水平的發酵中試車間，面積1268M2，主要設備包括10000L、3000L、250L發酵罐及與之配套的計算機自控系統，L-蛋氨酸中試設備，空壓機及鍋爐配套系統。
發展構想
新疆特殊環境微生物實驗室將在現有基礎上，進一步貫徹實施“開放、流動、聯合、競爭”的方針，接受同行專家學者申請開放課題和自帶課題來實驗室進行合作研究，與在微生物領域具有重要學術地位及較高研究水平的國內外科研院所和企業進行多種方式的協作聯合，積極促進學術及人才交流，促進科研成果轉化，使實驗室成為西北地區微生物學科進行科學研究、人才培養和學術活動的中心。
新疆特殊環境微生物實驗室廣泛利用社會資源進行實驗室的建設，將建設成為具有一流實驗儀器設備，一流實驗基礎設施，一流工作環境的開放實驗室。同時，依據自身特色和優勢，多渠道申請課題，爭取國家和自治區的重點支持。通過承擔國家重大項目、自然科學基金課題和自治區重點課題，為社會培養一批優秀科技人才，取得一批重大科技成果。
