新一代基因組測序——通往個性化醫療

《新一代基因組測序——通往個性化醫療》是2012年科學出版社出版的圖書，作者是M.賈尼特 。

基本介紹

• 書名：新一代基因組測序——通往個性化醫療
• 又名：Next-Generation Genome Sequencing:Towards Personalized Medicine
• 作者：[德]M.賈尼特 
• 譯者：薛慶中
• ISBN：978-7-03-033007-9
• 類別：理論專著/套用技術
• 頁數：234
• 定價：58.00
• 出版社：科學出版社 
• 出版時間：2012年1月
• 裝幀：平裝
• 開本：16 
• 叢書：生物信息學數據分析叢書

內容簡介

與傳統測序技術相比，新一代測序（NGS）技術具有超高速、高通量、低成本和高效益的強大優勢；這種新興技術的研發和新一代測序平台的建立對基因組研究、人類健康和社會認知都產生了重大影響，是當今前沿科學發展最為迅猛的領域。全書包括5個部分18章。第一部分和第二部分分別概述了傳統的Sanger DNA測序和新一代測序平台的工作原理、方法和特點；第三部分剖析了困擾測序技術瓶頸及其解決方案；第四部分介紹了測序的商業化套用和新興的測序平台；第五部分探討了新一代測序技術在基因組學研究中的廣泛套用。
本書由參與NGS技術開發和套用的研究人員和發明家撰寫，是全球第一本介紹新一代DNA測序技術的書。可作為高等院校生物學、醫學、農學等領域的師生和研究人員學習參考用書，也對希望了解個人基因組信息、個性化醫療、倫理學等問題的讀者有啟迪和幫助作用。

目錄

譯者序

前言

第一部分 Sanger DNA測序

1 Sanger DNA測序

1.1 Sanger測序的基礎

1.2 人類基因組計畫的未來

1.3 局限性以及未來的機會

1.4 生物信息學是關鍵

1.5 下一步將往哪裡走

第二部分 新一代測序：通往個性化醫療

2 lllumina基因組分析儀Ⅱ系統

2.1 文庫的製備

2.2 簇的創建

2.3 測序

2.4 配對末端讀序列

2.5 數據分析

2.6 套用

2.7 結論

3 套用系統生物公司（ABI）sOLDTM系統：基於連線的測序

3.1 引言

3.2 SOLIDTM系統概述

3.3 SOLIDTu系統套用

3.4 結論

4 新一代基因組測序：454/Roche GS FLX

4.1 引言

4.2 技術概述

4.3 軟體和生物信息學

4.4 研究套用

5 聚合酶克隆測序：歷史、技術及套用

5.1 介紹

5.2 聚合酶克隆測序的歷史

5.3 聚合酶克隆測序

5.4 套用

5.5 結論

第三部分 瓶頸：序列數據分析

6 新一代測序（NGS）數據分析

6.1 為什麼新一代序列分析有所不同？

6.2 序列搜尋策略

6.3 什麼是擊中，為什麼它對NGS十分重要？

6.4 記分：為什麼NGS的記分不同？

6.5 NGS序列分析的策略

6.6 後續數據分析

7 DNASTAR的新一代軟體

7.1 個人基因組及個性化醫療

7.2 新一代DNA測序——作為個性化基因組學的方法

7.3 不同平台的優勢

7.4 計算機挑戰

7.5 DNASTAR的新一代軟體解決方案

7.6 結論

第四部分 新興測序技術

8 實時DNA測序

8.1 全基因組分析

8.2 個性化醫療和藥物基因組學

8.3 生物防禦、法醫、DNA測試和基礎研究

8.4 簡單精巧：實時DNA測序

9 使用Z型DNA分子替換的TEM直接測序

9.1 引言

9.2 方法的邏輯性

9.3 最佳化改良核苷酸鑑定技術進行DNA序列單獨聚合的TEM目力解析度

9.4 TEM基板和可視化

9.5 利用聚合酶進行z一標籤核苷酸整合

9.6 當前和新的測序技術

9.7 精度

9.8 zs遺傳學公司提出的DNA測序技術的優勢

9.9 更長讀序列的優勢

10 單分子DNA條形碼方法及其在DNA圖譜和分子單體型中的套用

10.1 引言

10.2 單分子DNA條形碼方法中的關鍵技術

10.3 單分子：DNA圖譜

10.4 分子單體型

10.5 討j淪

11 光學測序：從圖像化的單分子模板採集

11.1 引言

11.2 光學測序循環

11.3 光學測序的展望

12 基於微晶片的Sanger DNA測序

12.1 基因組學分析的集成微流體裝置

12.2 Sanger測序微流體器件上網路聚合物的改進

12.3 結論

第五部分 新一代測序：真實地整合基因組分析

13 套用配對末端雙標籤多重測序進行轉錄組和基因組分析

13.1 引言

13.2 配對末端雙標籤（PET）分析的發展

13.3 利用GIS-PET進行轉錄組分析

13.4 利用ChIP-PET在全基因組上定位轉錄因子結合位點和表觀遺傳修飾

13.5 利用ChIA-PET在全基因組上鑑定長距離互作

13.6 展望

14 利用454測序平台研究古基因組學

14.1 引言

14.2 DNA降解的挑戰

14.3 DNA降解對古基因組學研究的影響

14.4 降解與測序的準確性

14.5 樣品污染

14.6 解決DNA損傷的方法

14.7 解決污染的方法

14.8 還存在哪些基本問題，將來的前景如何

15 ChIP-seq：蛋白質-DNA互作作圖

15.1 引言

15.2 歷史

15.3 染色質免疫沉澱測序（chIP-seq）方法

15.4 基於雙脫氧標籤Sanger測序

15.5 基於雜交的標籤測序

15.6 邊合成邊測序的套用

15.7 ChIP.seq的醫學套用

15.8 挑戰

15.9 ChIP-seq方法的展望

16 新一代測序技術在MicroRNA的發現和表達譜研究中的套用

16.1 miRNA的背景介紹

16.2 miRNA的鑑定

16.3 實驗方法

16.4 驗證

16.5 展望

17 基於標籤的轉錄組學分析DeepSAGE，優於微陣列

17.1 引言

17.2 DeepSAGE

17.3 數據分析

17.4 基於標籤的轉錄組表達譜的比較

17.5 表達譜未來的展望

18 新基因組學和個人基因組信息：倫理學問題

18.1 新基因組學和個人基因組信息：倫理學問題

18.2 新基因組學：它的特點是什麼？

18.3 倫理學的革新：為什麼我們需要它？

18.4 限制條款：全基因組學和本地倫理學觀

18.5 醫學倫理學和希波克拉底保密性

18.6 生物醫學倫理學的原則

18.7 臨床研究和知後同意

18.8 大規模研究倫理學：新觀念

18.9 個人基因組

18.10 個人基因組計畫：允許信息公開

英漢對照辭彙

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