擬南芥轉錄調控網路及其結構和演化研究

《擬南芥轉錄調控網路及其結構和演化研究》是高歌為項目負責人,北京大學為依託單位的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:擬南芥轉錄調控網路及其結構和演化研究
  • 項目類別 :面上項目
  • 依託單位 :北京大學
  • 項目負責人:高歌
科研成果 ,項目摘要,

科研成果

序號
標題
類型
作者
1
An Arabidopsis Transcriptional Regulatory Map Reveals Distinct Functional and Evolutionary Features of Novel Transcription Factors
期刊論文
Jinpu Jin; Kun He; Xing Tang; Zhe Li; Le Lv; Yi Zhao; Jingchu Luo; *Ge Gao
2
PlantTFDB 4.0: toward a central hub for transcription factors and regulatory interactions in plants.
期刊論文
Jin, Jinpu(#); Tian, Feng; Yang, De-Chang; Meng, Yu-Qi; Kong, Lei; Luo, Jingchu(*); Gao, Ge(*)

項目摘要

轉錄調控在植物生長發育和應對各種生物和非生物脅迫中發揮著關鍵作用。經過數億年的演化,植物形成一套獨特的系統來精確調控複雜的發育過程和快速回響外界的各種脅迫。一個全局範圍、高質量的轉錄調控網路不但對生物學功能研究至關重要,更有助於理解相關網路的結構設計與演化特徵。本課題擬採用文本挖掘和人工校驗的方式,收集並構建一個高質量的擬南芥轉錄調控網路,並使用此網路研究以下問題:1、轉錄因子與其靶基因在表達相關性上的總體模式如何?2、發育子網路和應激子網路在全局拓撲結構和結構元件組成上是否有所不同?3、與單細胞生物相比,擬南芥轉錄調控網路是否存在一些新的結構元件? 4、與祖先類型的轉錄因子相比,植物登入期間產生的新類型轉錄因子在轉錄調控系統中的位置是否有所偏好,性質是否有所不同?如有,是什麼原因造成的?通過對上述問題的研究來揭示植物轉錄調控網路的設計原理和探討新類型轉錄因子是如何促進轉錄調控網路演化的。

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