指定國立大學(英文:Designated National University),是日本政府為了進一步提高科研水平和創新能力,從2016年(平成28年)開始執行的科教政策。日本文部科學省在日本國立大學中,評選出具有世界最高水平的教育科研能力的成員,並命名為指定國立大學。日本政府在科研經費等許多政策法規上,對指定國立大學予以特殊支持。同時指定國立大學在管理運營、財政基礎等方面將享有更大的自主權。
迄2018年,通過日本文部科學省認定的指定國立大學有6所:東京大學、東北大學、京都大學、名古屋大學、東京工業大學和大阪大學。這6所著名高校均是學術研究懇談會(RU11)和八大學工學系聯合會等聯盟的核心成員。