批發商品流轉效益審計是對批發商品的收購、儲存、分配、調撥、銷售、運輸各項工作中的經濟效益進行的審核、稽查。其主要內容：(1) 對商品購進方面的效益審計，主要審核購進內部控制制度是否合理有效，是否依照購貨契約的數量、質量、價格進行採購; 在有多個供貨單位和供貨渠道的情況下，是否選取了最佳方案; 有無盲目採購造成商品積壓; 商品在途損耗是否合理，造成非正常損失的原因何在，對呆滯積壓，質次價高的商品，查明當初是怎樣購進的，採購人員有無受賄舞弊的行為; 對商品購進的業務處理是否合理高效等。
(2) 對商品儲存方面的效益審計，主要審查儲存控制制度是否合理有效，倉庫的管理和安全防護體系如何; 儲存商品的品種、數量是否合理，質量狀況如何; 已調未提商品、待用商品和委託代銷商品的管理如何等。(3) 對商品銷售方面的效益審計，主要審查商品銷售內部控制制度的合理有效性; 是否按照合理合法的銷售契約辦理銷售業務; 是否儘可能做到了快進快銷，有無由於管理不善造成某些商品不得不降價銷售的情況; 有無違反國家價格政策，對緊俏商品非法抬價、搞不正當關係交易、貪污受賄等行為。在批發商品流轉效益審計中，可用商品周轉次數等效率指標來檢查商品周轉的快慢，與過去的周轉情況進行比較，從中分析出周轉快慢的原因，提出改進建議。商品周轉次數的計算公式是： 商品周轉次數=商品銷售總額÷商品平均儲存額。
