德州檢驗檢疫局前身為德州進出口商品檢驗局，成立於1995年10月28日。1999年11月28日，經國家檢驗檢疫局批准，正式成立“德州出入境檢驗檢疫局”增加了出入境動植物檢疫和衛生檢疫職能，實現了“三檢合一”，是國家質量監督檢驗檢疫總局設在德州的分支機構，正處級行政單位，隸屬山東出入境檢驗檢疫局，實行垂直管理體制。
2017年11月，德州出入境檢驗檢疫局獲第五屆全國文明單位榮譽。
主要職能,內設科室,聯繫地址,
主要職能
依照《中華人民共和國進出口商品檢驗法》及其實施條例、《中華人民共和國進出境動植物檢疫法》及其實施條例、《中華人民共和國國境衛生法》及其實施條例、《中華人民共和國食品衛生法》等法律法規，承擔轄區內出入境衛生檢疫與進出口食品衛生監督檢驗，動植物檢疫和進出口商品的檢驗，對涉及健康、衛生、安全、環境保護以及國計民生關係密切的出入境重要對象進行監管；對出入境人員、交通工具、貨櫃和應檢物品進行監管和檢驗檢疫。
德州出入境檢驗檢疫局
內設科室
德州出入境檢驗檢疫局內設8個科室：辦公室、法制與綜合業務科、檢務科、動植物檢驗檢疫科、輕紡機電檢驗科、財務科、後勤保障科、技術中心。
辦公室工作職能：分管文檔密、人事、財務、思想政治工作、精神文明建設、廉政建設以及其他行政事務管理。
綜合科工作職能：負責法制工作，綜合業務協調、督查，綜合體系管理，績效考核，國外退運、通報調查及科技工作。
檢務科工作職能：分管出入境報檢簽證、產地證業務、報檢員註冊、報檢單位備案登記、“兩證”認證等工作。
動植物檢驗檢疫科工作職能：分管動物及其產品檢驗檢疫、植物及其產品檢驗檢疫、食品檢驗檢疫、出口衛生註冊評審、進出境貨櫃檢疫、木質包裝檢疫等工作。
輕紡機電檢驗科工作職能：分管紡織服裝類、棉花、化礦五金類產品、廢物原料等產品的檢驗檢疫工作；質量許可證、強制認證等工作；運輸包裝性能檢驗、危包使用鑑定等工作。
財務科工作職能：負責機關及所屬單位財務核算及收費管理。
後勤保障科工作職能：負責全局後勤保障等工作
技術中心工作職能：負責進出境動植物及其產品以及食品中微生物、生物毒素、農藥殘留、獸藥殘留、重金屬等有害物質常規理化項目的法定檢驗檢測和外部委託檢測業務。
聯繫地址
德州市德興中大道1269號
