微生物源性致癌物是微生物的致癌性代謝產物。包括兩類：①真菌毒素，已鑑定的致癌性毒素見附表。②抗生素(antibiotics)，除氯黴素(chloramphenicol)和灰黃黴素(griseofulvin)為抗菌藥物外，其餘為抗腫瘤藥物，如放線菌素類(actinomycins)、絲裂黴素(mitomycin C)、阿黴素(adriamycin)、正定黴素(daunomycin)、洋橄欖黴素(elaiomycin)、乙硫氨酸(ethionine)、氮絲氨酸(azaserine)、亞硝基去甲菸鹼(nitrosonornicotine)及鏈脲黴素(streptozotocin)等。國際致癌研究所(IACR)提出黃麴黴毒素和氯黴素為人類可疑致癌物（證據有限）。人類肝癌可能與黃麴黴毒素有關。據報導，經氯黴素治療後出現骨髓抑制的病人可發生白血病，而灰黃黴素可致小鼠肝癌。
