廈門市漁港漁船管理處是廈門市海洋和漁業局直屬單位，（加掛“中華人民共和國廈門漁港監督局”、“中華人民共和國福建廈門漁業船舶檢驗局”“廈門中華白海豚文昌魚自然保護區管理處”）
（一）負責漁港及其設施的建設、使用、維護、改造的監督管理工作。
（二）負責漁業船舶的登記管理工作。
（三）負責船舶進出漁港的簽證管理及漁港設施的安全監督管理工作，負責漁港水域交通、漁船的安全救助網路的建設。
（四）負責漁業船舶船員、職務船員、報務員的資格考試、發證、審證和換證工作。
（五）負責漁業船舶、船用產品監督檢驗工作，負責漁業船舶建造圖紙的審核工作。
（六）負責對漁船修造廠、漁業船舶設計單位的資格認證工作。
（七）負責漁業無線電台(站)的設定與使用、頻率管理和漁業無線電設備研製、生產、銷售、進口等管理工作，負責漁業安全通訊網的建設。
（八）承擔漁業船舶海洋交通戰備動員工作。
（九）代征、代繳漁港、漁業無線電、漁業船舶和職務船員的相關費收。
