序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding proteins)是指染色體上與特異DNA序列相結合的蛋白質,又稱非組蛋白.非組蛋白是真核細胞特有的一類酸性蛋白質,富含天門冬氨酸、谷氨酸等酸性胺基酸,帶負電荷,種類可多達數百個。
基本介紹
- 中文名:序列特異性DNA結合蛋白
- 外文名:醫學細胞生物學(第三版)
序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding proteins)是指染色體上與特異DNA序列相結合的蛋白質,又稱非組蛋白.非組蛋白是真核細胞特有的一類酸性蛋白質,富含天門冬氨酸、谷氨酸等酸性胺基酸,帶負電荷,種類可多達數百個。
序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding proteins)是指染色體上與特異DNA序列相結合的蛋白質,又稱非組蛋白.非組蛋白是真核細胞特有的一類酸性蛋白質,富含天門冬氨酸、谷...
上游結合因子 (ubf)是一種特異的DNA結合蛋白,可以與UCE(上游控制序列)結合,還可以與核心元件上游的一段序列結合。
在不同的基因組之間,這些非組蛋白所識別的DNA序列在進化上是保守的。這類序列特異性DNA結合蛋白具有一個共同特徵,即形成與DNA結合的螺旋區並具有蛋白二聚化的能力。4、功能多樣性:雖然與DNA特異序列結合的蛋白質在每一個真核細胞中...
《基於結構的DNA結合蛋白結合殘基預測及結合特異性分析》是依託武漢大學,由劉娟擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 結構基因組計畫產生了大量蛋白質結構數據,其中相當部分功能未知,揭示它們的功能是當前重要任務之一。蛋白質往往通過與其他...
此外,人們把一個與A-box和B-box結構域同源,約含85個胺基酸的重複區命名為DNA結合基元,為區別起見,將DNA結合基元的蛋白稱為HMG-box。HMG-box起源古老,其中包括序列特異性DNA結合蛋白和非特異性結合蛋白,系辨認和結合變形DNA所必需...
通過蛋白結構域特異性結合DNA序列,轉錄因子可特異地調控基因表達。為了維持DNA結合特異性,轉錄因子在結構上和序列上的特性可以保證其準確地識別DNA結合位點。然而,轉錄因子結構域胺基酸位點的共進化同DNA結合間的相互關係仍未深入研究。本...
雙鏈DNA結合域,DNA結合蛋白中與雙鏈DNA結合的結構域。雙雜交系統的基礎是在一些轉錄因子上發現的模域(modular domains):一個DNA結合域,它可以結合一段特異的DNA序列,和一個轉錄激活域,這個轉錄激活域與基礎轉錄機制相作用(1)。雙...
精確構建所需DNA模版是保證融合蛋白多樣性及穩定性的基礎。在獲得目標DNA序列後,將其連線進入特定的載體之中,以獲得充足融合蛋白質粒。由於遺傳基因的簡併性,同一種融合蛋白可對應著多種DNA序列,但序列合成蛋白效率卻與擴增時選取的...
這類重組依賴於小範圍同源序列的聯會,重組也只發生在同源的短序列的範圍之內,需要位點特異性的蛋白質分子參與催化,重組的蛋白不是rec 系統而是int 等,如噬菌體l 的定點插入。重組時發生精確的切割、連線反應,DNA不失去、不合成。兩...
DNA複製的終止發生在特定的基因位點,即複製終止位點。該位點的終止位點序列被與該序列結合的阻止DNA複製的蛋白質識別並結合,阻止了複製叉前進,複製終止。細菌物的DNA複製末端位點結合蛋白又稱Ter蛋白。因為細菌具有環狀染色體,所以當兩個...
轉錄因子(Transcription Factor,TF)也稱反式作用因子,其可直接或間接與基因啟動子區域中順式作用元件特異性結合、對基因轉錄進行調控的蛋白質。其主要功能是激活或抑制基因的轉錄效應。典型的轉錄因子一般具有4個功能結構域,即DNA結合...
非組蛋白主要是指與特異DNA序列相結合的蛋白質,所以又稱序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding protein)。利用凝膠延滯實驗(gel retardation assay),可以在細胞抽提物中進行檢測。首先製備一段帶有放射性標記的已知特異序列...
分子雜交(molecular hybridization)是利用分子間特異性結合的原理對核酸或蛋白質進行定性、定量分析的一項技術,主要包括核酸雜交和蛋白質雜交。核酸分子雜交是在核酸變性及復性基礎上建立起來的實驗技術,是具有一定同源序列的兩條單核苷酸鏈...
TALE(TranscriptionActivator–Like Effectors)技術是一種靶向基因修飾技術。來自植物細菌Xanthomonassp的TAL蛋白的核酸結合域的胺基酸序列與其靶位點的核酸序列有恆定的對應關係。結構 :TALE是由12個或以上特異性識別DNA的串聯“蛋白模組”和...
這種多聚體的形成是轉錄因子上的寡聚化位點(oligomerization site)相互作用的結果,寡聚化位點的胺基酸序列很保守,大多與DNA結合區相連並形成一定的空間構象。除二聚化或多聚化反應,還有一些調節蛋白不能直接結合DNA,而是通過蛋白質-...
ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質免疫共沉澱技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,並對其進行純化與文庫構建;然後對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標籤精確定位到基因組上,從而獲得全基因...
這項技術通過蛋白質與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質的靶基因,被廣泛套用於體內轉錄調控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。該技術常與DNA晶片和分子克隆技術相結合。簡介 真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在...
因此,在人細胞的整個基因組當中只有很少一部分(約占2-3%)的DNA序列用以編碼蛋白質。主要特點 1.真核生物基因組DNA與蛋白質結合形成染色體,儲存於細胞核內,除配子細胞外,體細胞內的基因的基因組是雙份的(即雙倍體,diploid),即...
PL啟動子的冷反應由E.coli整合宿主因子,一種與DNA結合的序列特異性多功能蛋白來正調控[45,46]。主要冷應激基因cspA啟動子同樣也被證明在低溫具有活性。對cspA和PL啟動子進行分子剖析,鑑定了在較低溫度下參與增強轉錄的特異性DNA區域...
原核生物的轉錄是通過單一類型的RNA聚合酶進行的,需要一個稱為Pribnow盒的DNA序列以及sigma因子(σ因子)以開始轉錄。真核生物的轉錄由三種類型的RNA聚合酶進行,每種RNA聚合酶需要一種稱為啟動子的特殊DNA序列和一組DNA結合蛋白(轉錄...