巨型染色體 giant chromosome 比普通染色體顯著巨大的染色體的總稱。包括雙翅目昆蟲的唾腺、食道和小腸的表皮、馬爾比基氏管和神經細胞等內見到的多線染色體，以及在某種動物的卵母細胞和果蠅屬的精母細胞內的燈刷染色體等。過去，巨型染色體曾被用來證明染色體是基因的載體，近年來，它作為解釋遺傳信息的調節機制的最適宜的材料之一而被廣泛套用。
