中國學術界關於西方哲學史的劃分通常如下：希臘-羅馬哲學、中世紀哲學、近代哲學、德國古典哲學、然後就是當代哲學了。就年代而言，希臘-羅馬哲學的跨度為西元前8世紀到西元後5世紀，共一千餘年。期間出現了早期物性論者，柏拉圖、亞里士多德、晚期希臘思潮，稱為古典時期。西元40後，出現了基督教，並開始和希臘思想家發生關係。在接下來的4百餘年時間裡，越來越多的希臘哲學家成為基督徒，構成了基督徒思想家群體，如查士丁、愛任紐、奧利金、德爾圖良、安布羅、奧古斯丁等，一般稱為早期教父。他們在為基督信仰作辯護時寫了大量的著作，形成了一套獨特的思想體系和說話方式。他們的思想直接規定西方思想史的發展。我們稱此為古希臘思想。
然而，在西方學術界，哲學史學術界雖然一般不處理這些早期教父們的思想；但是，在神學學術界，他們的思想卻是主要研究對象。因此，儘管哲學史學術界和基督教神學學術界之間的交往不甚暢通，但西方學術界至少沒有把早期教父們的著作擱置一邊不加研究。不幸的是，中國學術界一直跟著西方哲學史學術界走，因而幾乎完全忽略了早期教父們的思想。對於中國讀者來說，基督教對西方思想史發展的影響和作用幾乎可以忽略不顧。這個盲點極大地妨礙了中國學術界的西學研究，也妨礙了中國基督教的發展。
山東大學古希臘思想研究中心希望避免西方學術界那種割裂希臘哲學史和基督教思想史的做法，把整個希臘思想史發展當作一個整體來對待。從希臘哲學的古典時期開始，發展到基督教教父時期。山東大學古希臘思想研究中心認為，就思想史而言，這個發展不是一個偶然的過程，而是一個整體發展。具體來說，基督教神學家（大都是皈依基督教的希臘哲學學生）分享了希臘古典哲學的根本問題（特別是真理認識困境），努力用基督信仰來分析並解決這些問題。這些努力構成了早期教父們的主要工作，催生了基督教神學。因此，希臘哲學史從古典哲學到基督教神學的過程是一個完整的思想發展過程。這個思想史進程乃是山東大學古希臘思想研究中心的研究領域。
