層次性場地風險評估，是指根據風險評估的目的，場地風險評估可分成2〜4個繁簡程度不同的層次或階段。一般有三個層次。第一層次，若場地條件、土壤、地下水、敏感受體、暴露途徑等情況與土壤或地下水篩選值制訂依據情況相同，就不再進行場地風險評估，而直接採用篩選值作為修復啟動值。第二層次，通常要求開展詳細的場地調查，建立場地概念模型，獲取關注污染物在不同介質中的濃度、時空分布甚至半衰期、生物有效性參數、場地土壤和含水層特徵參數等，根據場地未來利用方式採用人體健康和生態風險評估的方法制定具體場地土壤、地下水等污染介質的修復啟動值。第三層次，健康風險評估以詳細場地調查結果和修正的場地概念模型為依據，利用場地調查所得的參數進行風險計算和特定場地修復啟動值的計算。
對環境介質中污染物濃度的計算可採用其機率分布，而不一定要使用實測的最大濃度或95%分位值，根據場地實際情況，離場遷移也應考慮。另外，在污染物遷移、轉化模型選擇上，除了推薦模型外，可根據場地實際情況選用或建立適合特定場地的模型。
