《小鼠雌性生殖幹細胞全基因組範圍H3K4me3和H3K27me3的研究》是依託上海交通大學，由趙小東擔任項目負責人的重大研究計畫。
基本介紹
- 中文名：小鼠雌性生殖幹細胞全基因組範圍H3K4me3和H3K27me3的研究
- 項目類別：重大研究計畫
- 項目負責人：趙小東
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
由組蛋白各種翻譯後修飾和DNA甲基化構成的表觀遺傳修飾與細胞特異性的轉錄因子協同作用，決定著多細胞生物的細胞分化及發育。組蛋白不同的化學修飾所組成的組蛋白密碼，影響染色體結構和基因表達活性，從而使幹細胞的發育潛能得以動態地調控。小鼠雌性生殖幹細胞（FGSC）由我國學者首次在國際上分離，表觀遺傳修飾對FGSC的維持及分化的作用機制並不清楚。本項目利用基於測序的ChIP-PET策略，對FGSC全基因組範圍的組蛋白修飾H3K4me3和H3K27me3展開研究，並結合與之對應的轉錄組分析和多能性轉錄因子Oct4主導的轉錄調控網路分析，系統性地揭示不同組蛋白修飾模式對FGSC自我更新、多能性的維持及其定向分化的影響。
結題摘要
摘要：包括組蛋白甲基化、乙醯化、磷酸化等各種組蛋白翻譯後修飾和DNA甲基化在內的表觀遺傳調控與細胞特異性的轉錄因子介導的轉錄調控協同作用，通過定義細胞類型特異性的基因表達譜決定著多細胞生物的細胞分化及發育。組蛋白不同的化學修飾所組成的“組蛋白密碼”，影響染色體結構進而上調或者下調基因表達活性，從而使幹細胞的發育潛能得以動態地調控。小鼠雌性生殖幹細胞（mFGSC）由我國學者首次在國際上分離，表觀遺傳修飾如何參與FGSC細胞內的基因表達，進而影響FGSC的自我更新和發育的多能性，這些科學問題並不清楚。 為了理解表觀遺傳調控在FGSC細胞所發揮的作用，本項目利用基於申請者研發的基於高通量測序的ChIP-PET策略，對FGSC全基因組範圍的兩種組蛋白修飾H3K4me3和H3K27me3展開研究。我們發現FGSC基因組上一共含有709個H3K4me3修飾位點以及1558個H3K27me3修飾位點，這些組蛋白修飾共涉及近兩千個基因。其中有些基因，比如對維持FGSC狀態非常重要的基因BMP家族成員以及Ddx家族成員都攜帶H3K4me3修飾。本項目通過對FGSC全基因組範圍組蛋白修飾的研究，為系統性地揭示不同組蛋白修飾模式對FGSC自我更新、多能性的維持等分子機制奠定了基礎，有利於進一步推動FGSC分子生物學的研究。
