小紅門清真寺是中共十一屆三中全會後朝陽區陸續開放的9座清真寺之一（其他8座分別是常營清真寺、南下坡清真寺、八里莊清真寺、康營清真寺、萬子營清真寺、管莊清真寺、楊閘清真寺、西會清真寺），為一座新建的清真寺。 這座清真寺後來移地新建，成為如今位於三台山村西北部的清真寺。
