《小波分析在定量蛋白質組學中的幾個套用》是依託浙江大學，由莫群擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：小波分析在定量蛋白質組學中的幾個套用
- 依託單位：浙江大學
- 項目負責人：莫群
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
定量蛋白質組學可以動態、整體地研究腫瘤等複雜、多因素的重大疾病。它被認為是本世紀六大前沿課題之一。小波基具有良好的時－頻局部性。用它對海量質譜數據做像信號去噪之類的處理非常有效。本項目研究小波分析在定量蛋白質組學的三個套用：1.用小波分析改善液質聯用(LC-MS)和液相色譜－串聯質譜聯用(LC-MS-MS)的數據分析。2.將小波濾波方法引入蛋白質組學中的ASAPRatio程式，來取得更精確的結果。3.開發流水線軟體系列，用蛋白質組學資料庫來研究蛋白異形體和蛋白翻譯後修飾(PTMs)。本項目的難點和關鍵問題有：1. 提高質譜數據定量分析軟體的精確性。2.利用質譜數據尋找由可變剪下形成的新的蛋白異形體。3.利用質譜數據尋找蛋白質翻譯後修飾(PTMs)。本項目的成功實施，將產生更精確以及更有效地利用高通量質譜數據的算法和軟體。對有效地利用差異蛋白質組學找出腫瘤標記物和藥物靶點產生積極影響。
結題摘要
本項目組在基金委資助下，對小波分析在定量蛋白質組學下的套用進行研究。本項目組完成了預期的目標，取得了很好的成果。在理論方面，本項目組主要的研究內容是小波框架的構造以及指數衰減的小波面具的分析。本項目組共發表12篇SCI期刊論文（均有基金標註），共有10次引用。其中有4篇發表在本專業的國際頂級期刊上。這4篇論文的影響因子均大於3，本人均為第一作者。另外還有一篇本項目組成員參與完成的化學方面的論文，其中用到了小波分析，影響因子為13.198。在套用方面，本項目組的成員還參與完成1項相關軟體和專利。該軟體套用以小波分析為核心的小波域圖像去噪算法，對液質聯用的多肽滴定數據實現更精確的質譜分析。本項目組積極宣傳所做成果。在國際會議上累計被邀請做了11人次的學術報告，其中本人和李松教授分別兩次被邀請出國做學術報告。在人才培養方面，本項目組成員中有兩個博士後在基金資助期間順利出站；三名博士在基金資助期間順利畢業；一名碩士在資助期間順利畢業。目前本項目組已建立一定的學術聲譽。比如說，包括本人在內，本項目組中多人頻頻收到相關國際期刊的審稿邀請。其中包括《IEEE Transactions on Information Theory》，《Applied and Computational Harmonic Analysis》這樣的本專業的國際頂級期刊。
