套用EWASs策略研究部分性癲癇的表觀遺傳學機制

《套用EWASs策略研究部分性癲癇的表觀遺傳學機制》是依託中南大學，由肖波擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：套用EWASs策略研究部分性癲癇的表觀遺傳學機制
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：肖波
• 依託單位：中南大學

項目摘要

部分性癲癇是一類具有遺傳傾向的多基因複雜性疾病，其臨床表型多種多樣，由遺傳和環境因素共同影響著疾病的發生和發展，但其具體的發病機制尚未完全明確。研究表明，表觀遺傳學是重要的基因表達調控模式，其中DNA甲基化與部分性癲癇的發生髮展密切相關。本項目擬套用表觀基因組關聯研究（EWASs）策略，採用Infinium@Human Methylation45晶片從全基因組範圍內探討部分性癲癇患者DNA甲基化模式，篩選癲癇相關的關鍵基因或位點。從系統生物學的角度出發，選用基於通路的甲基化數據分析，預測可能改變的蛋白結構和功能及影響的信號通路，從表觀遺傳學層面探討關鍵基因甲基化對癲癇的影響，以揭示部分性癲癇發生的表觀遺傳學機制，並試圖篩選到甲基化標誌物，從而為進一步探討癲癇發生的分子機制提供實驗依據。

結題摘要

顳葉癲癇（temporal lobe epilepsy, TLE）是成人部分性癲癇最常見的形式，由遺傳和環境因素共同影響疾病的發生和發展。DNA甲基化是目前研究得最好的表觀遺傳學機制之一。近年研究表明，TLE的發生和發展可能與DNA甲基化有關，但其具體的發病機制尚未完全明確。本研究利用甲基化晶片對TLE患者及健康對照者進行全基因組DNA甲基化檢測，篩選差異甲基化編碼基因、miRNA和lncRNA，運用生物信息學方法進行功能分析深入探究其與TLE發生髮展的內在關聯。結果發現，TLE患者外周血全基因組水平存在甲基化異常，編碼基因、miRNA和lncRNA基因甲基化均存在變化，以甲基化程度升高為主。差異甲基化編碼基因、miRNA和lncRNA基因參與多條生物學通路，甲基化改變可能在TLE發病及耐藥機制中起到重要作用。焦磷酸測序驗證了部分甲基化晶片結果的準確性。全基因組DNA甲基化研究不僅能夠加深對TLE疾病機制的理解，而且有助於找到TLE或臨床相關的生物標記物，進而對TLE的診斷和治療提供新的靶點和導向。