《套用ChIP-Seq技術進行白血病異常轉錄因子及表觀遺傳學研究》是依託上海交通大學，由張濟擔任項目負責人的重大研究計畫。
基本介紹
- 中文名：套用ChIP-Seq技術進行白血病異常轉錄因子及表觀遺傳學研究
- 項目類別：重大研究計畫
- 項目負責人：張濟
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
白血病是嚴重危害人類生命健康的惡性腫瘤之一，其基本生物學特徵為分化障礙、凋亡逃逸、增殖失控等，臨床表現為未成熟細胞的異常增生。研究發現，不僅基因缺失、突變和重組等遺傳學改變在白血病的發生髮展過程中發揮著重要作用，而且DNA甲基化，組蛋白修飾和microRNA等表觀遺傳學機制也不可或缺。本項目擬通過採用結合了染色質免疫共沉澱技術和第二代高通量平行測序技術的ChIP-Seq活體蛋白和DNA相互作用研究體系，將目標鎖定在急性白血病M2亞型和M3亞型的組蛋白密碼（Histone code）解析，及與關鍵轉錄因子或致病融合蛋白（PML-RARa, AML-ETO）的相互作用關係的研究，以期從遺傳學和表觀遺傳學方面相對全面地解析白血病的發生髮展過程中細胞編程和重編程的機制，，並為臨床診斷、預後發現新型的組蛋白修飾標識，同時將為通過表觀干預等手段來有效治療白血病提供強有力的支持。
結題摘要
細胞編程與重編程最終取決於於染色質的高維結構的改變，而這種改變則是DNA序列、DNA修飾（如甲基化）、組蛋白修飾、DNA的順式調控元件、反式調控因子以及非編碼RNA等綜合因素的協同結果。換而言之：染色質的高維結構所攜帶的遺傳學信息與表觀遺傳學信息的協同作用決定細胞編程與重編程的發生與否。而伴隨這種發生與否的重要表現之一就是基因和非編碼RNA表達的改變。因此，全面、系統地了解特定情況下細胞編程與重編程的根本機制需要全面、系統地了解遺傳學信息與表觀遺傳學信息在特定情況下的互作規律。本項目針對維甲酸治療早幼粒白血病這一絕佳的編程與重編程模型、立足於全基因組水平的多種轉錄因子結合位點以及數十種組蛋白修飾位點的組學數據、進行了系統有效地分析。雖然本項目的重要突破（包括重要發現及方法學的突破）正在整理投遞當中，與此同時所開發了一系列相關的生物信息及計算生物學方面，以及在腫瘤幹細胞藥物、腫瘤耐藥及適應性藥物組合等方面的可喜進展也為此項目增加了不少的色彩。本項目全面完成的意義不僅僅在於解析白血病發生以及有效治療的根本機制，更為重要的是為研究其它腫瘤及疾病以及細胞細胞編程與重編程的基本規律奠定理論基礎。
