《多肽分子與siRNA的相互作用及其在藥物輸運中的機制研究》是依託南京大學，由盛樂標擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：多肽分子與siRNA的相互作用及其在藥物輸運中的機制研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：盛樂標
- 依託單位：南京大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
相互作用是生物分子行使其功能的物理基礎。對胺基酸殘基對(Amino Acid Pair)之間的相互作用研究，將為多肽分子設計提供相互作用層面規律性的參考，為從頭分子設計引入新的思路，幫助人們設計出具有預期形貌或功能的新型分子。多肽與siRNA相互作用的研究，將為RNA藥物研發中最棘手的輸運問題的解決提供物理支撐。本項目擬研究四個方面的內容：(1)基於胺基酸殘基對之間的相互作用規律，對已設計自組裝多肽分子進行改進和重新設計；(2)基於全原子分子動力學模擬及AFM等實驗手段對新設計多肽分子自組裝行為的研究；(3)多肽分子與siRNA在生理條件及酸、鹼環境下的相互作用研究；(4)多肽分子結合siRNA並幫助其輸運的機制及可能的套用研究。
結題摘要
本項目結合理論模擬和實驗研究了蛋白質分子與納米顆粒表面相互作用、脫氧核苷酸殘基相互作用在 G-quadruplex摺疊中的影響、離子互補肽C6M1與siRNA分子相互作用等，基本涵蓋了蛋白質分子、DNA/RNA分子以及多肽與RNA之間的相互作用。主要內容包括：(1) 利用基於停-流的快速混合技術研究了蛋白質分子GB1在聚苯乙烯納米顆粒表面的吸附過程，發現了疏水作用在其吸附和去摺疊過程中的重要作用，並提出了兩步可逆模型；（2） 通過模擬研究了DNA G-quadruplex的摺疊過程及中間態，發現非天然態相互作用在加速其摺疊過程中起著重要作用；(3) 研究了自組裝多肽EAK16-II與抗癌藥物EPT之間的相互作用，提出了分子結合模型，並確認了不同EPT分子狀態對癌症治療效力的影響；(4) 研究了自組裝多肽C6M1與eGFP siRNA分子之間的結合特性，以及sense、anti-sense strand siRNA分子之間的相互作用，獲得了基本相互作用信息。上述結果對我們總結相互作用規律，設計新的用於藥物輸運的多肽分子具有重要的參考意義。
