多座位型同工酶是指由不同基因座位決定的同工酶。例如乳酸氫酶有A、B兩種亞基，分別由LDHA基因(定位於11p15-p14)和LKHB基因(定位一起12p12.2-p12.1)所決定。磷酸葡萄變位酶的3個不同肽鏈分別由不同座位的基因編碼。PGM1定位於1p22.1、PGM2定位於4p14-q12、PGM3定位於6q12。
PGM1定位於1p22.1、PGM2定位於4p14-q12、PGM3定位於6q12。以LDH同工酶為例，LDH是A、B兩種亞基不同比例組成的四聚體，依電泳速度可有5種表現型:LKH1(B4)、LDH2(B3A)、LDH3(B2A2)、LDH4(B1A3)及LDH5(A4)。如果A或B亞基再有不同突變，通過各種組合可以形成多種多樣的變異類型。
