多位點序列分型

多位點序列分型(multilocus sequence typing,MLST)是一種基於核酸序列測定的細菌分型方法。這種方法通過PCR擴增多個管家基因內部片段並測定其序列,分析菌株的變異。MLST操作簡單,結果能快速得到並且便於不同實驗室的比較,已經用於多種細菌的流行病學監測和進化研究。隨著測序速度的加快和成本的降低,以及分析軟體的發展,MLST逐漸成為細菌的常規分型方法。

基本介紹

  • 中文名:多位點序列分型
  • 外文名:multilocus sequence typing,MLST
  • 定性:基於核酸序列測定的細菌分型方法
  • 優點:操作簡單,結果能快速得
多位點序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)是近年來發展很快的分子生物學分析方法,具有很高的分辨能力,既適於分子流行病學研究,也可用於分子進化學的研究.通過分析多個管家基因(Housekeeping gene)450bp左右的核心片段的核酸序列,從而對菌株的等位基因進行多樣性的比較,不同的菌株對應不同的序列型(Sequence type).所以MLST越來越多的被作為能進行國際間菌株比較的常用工具,建立一種更為準確的分型系統方法.並且套用於研究出現的不同的抗生素抵抗株,毒力或抗原的相關特殊基因型,及新的變異株引起的疾病流行等流行病學分析,進行生物進化和種群結構的研究。

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