軸絲是纖毛本體的內部由微管及其相關蛋白組成的芯，大多數纖毛的軸絲是屬於9+2型的，外周為九組二聯絲微管規則排列一周，成為外周二聯絲（peripheral doublet）。每組外周二聯絲是由兩條微管組成，一條為整管，成為A亞絲（A subfiber），另一條為“C”字型的半聯絲B亞絲。A亞絲縱向上按一定間隔排列著許多短臂，每一水平上有兩條，外側者為外臂，內側者為內臂。短臂伸出的方向朝著緊鄰的外周二聯絲的B亞絲
