墨脫德爾貢河特有魚類國家級水產種質資源保護區總面積278公頃，其中核心區面積44.1公頃，實驗區面積233.9公頃。特別保護期為每年3月1日至7月20日。保護區位於西藏自治區墨脫縣德爾貢河及其上游支流水域，地理坐標範圍在東經95°07′03″～95°13′18″，北緯29°07′31″～29°13′31″之間。核心區河段總長度23.39千米，包括從德爾貢河上游（起點坐標分別為西那河上游（95°07′03″E，29°08′33″N）、嘎瑪河上游（95°10′57″E，29°07′33″N）、果西河上游（95°13′18″E，29°07′31″N）流經到背崩鄉德爾貢村（95°09′17″E，29°11′55″N）的所有河段範圍。實驗區河段長度4.41千米，包括從背崩鄉德爾貢村（95°09′17″E，29°11′55″N）到雅江匯入點（95°07′50″E，29°13′31″N）的河段。保護區主要保護對象為淺棕條鰍、平鰭裸吻魚、墨脫四須䰾、西藏墨頭魚、墨脫裂腹魚、弧唇裂腹魚、黃斑褶鮡、墨脫紋胸鮡、平唇鮡、藏鰋。
