《基於RNA-seq技術的中藥巴戟天轉錄組分析和分子標記挖掘》是依託深圳大學，由王西亮擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基於RNA-seq技術的中藥巴戟天轉錄組分析和分子標記挖掘
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：王西亮
- 依託單位：深圳大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
巴戟天以根入藥，為我國四大南藥之一，是重要的傳統中藥材，具有補腎壯陽、增強免疫力和抗抑鬱等多種功效。目前對巴戟天的研究主要集中於藥理功能、化學成分等方面。基因水平的研究卻比較少，尤其缺乏基因組和轉錄組信息，也沒有快速鑑定巴戟天品質優劣及辨別混偽品的分子標記。為了更好的理解巴戟天的生長發育機理與促進巴戟天的產業化發展，本項目擬利用二代測序技術對巴戟天多組織多樣本進行高通量測序，基於轉錄組從頭拼接與比較轉錄組學的方法，系統解析巴戟天莖、葉、根、種子等組織的基因表達譜；鑑定與巴戟天藥用成分（耐斯糖）協同差異的基因，挖掘可快速檢測藥用成份含量的巴戟天特異的分子標記；建立巴戟天專題資料庫。本項目的順利實施，有望挖掘出能快速區分品質良莠及混偽品的分子標記，鑑定出辨別產地的遺傳標記，從而為巴戟天的選育工作與產品分級提供指導，為利用基因工程技術改良巴戟天提供數據基礎。
結題摘要
巴戟天以根入藥，為我國四大南藥之一，是重要的傳統中藥材，具有補腎壯陽、增強免疫力和抗抑鬱等多種功效。目前對巴戟天的研究主要集中於藥理功能、化學成分等方面。基因水平的研究卻比較少，尤其缺乏基因組和轉錄組信息，也沒有快速鑑定巴戟天品質優劣的分子標記。為了更好的理解巴戟天的生長發育機理與促進巴戟天的產業化發展，本項目利用二代測序技術對巴戟天的根進行高通量RNA測序，基於轉錄組從頭拼接與比較轉錄組學的方法，系統解析巴戟天根的基因表達譜；篩選廣東產巴戟天特異或高表達的基因，挖掘可快速檢測藥用成份含量的巴戟天特異的分子標記。本項挖掘出能快速區分品質良莠的分子標記，鑑定出辨別產地的遺傳標記，從而為巴戟天的選育工作與產品分級提供指導，為利用基因工程技術改良巴戟天提供數據基礎。
