《基於高通量DNA測序的鄱陽湖微生物生態研究》是依託南昌大學，由吳凌偉擔任項目負責人的地區科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基於高通量DNA測序的鄱陽湖微生物生態研究
- 項目類別：地區科學基金項目
- 項目負責人：吳凌偉
- 依託單位：南昌大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
湖區環境污染問題引起廣泛關注，及時快速準確地監測鄱陽湖區的生態環境狀況是發展生態經濟的重 要保證。微生物的分布是湖區生態環境的一個重要 指標。由於核糖體RNA和它的基因具有很好的保守性，可作為可靠的微生物生態學標誌，用來計算自然界物種之間的親緣關係，因此核糖體DNA基因廣泛應 用於分子基因分析。本研究以微生物16S RNA基因為 研究對象，使用最新高通量測序技術，測出某一區域所有微生物的16SRNA基因序列，通過生物 信息學分析，找出物種的特異性序列及其豐度，從 而得出該地區微生物的分布情況。本項目已開展了初步研究，我們對鄱陽湖的一個特定區域取樣，進行了測序研究，測定的結果較能真實反應微生物的分布情況。本研究提出了一種新型的研究微生物生態方法，具有高通量和高準確性，可供對流域內污染源及污染治理情況進行數據分析，為江西工業可持續發展及科學發展規劃提供依據。
結題摘要
本課題利用高通量測序技術對鄱陽湖微生物生態多樣性進行了研究，發現在域（Domain）的水平上，古生菌（Archaea）占0.2%，絕大部分（99.705%）屬於細菌域；細菌域中在門（Phyla）水平上，變形菌門45%、擬桿菌門13%、厚壁菌門8%、放線菌門7%、浮黴菌門5%、疣微菌門4%、藍菌門4%、酸桿菌門4%、綠彎菌門2%、裝甲菌門1%、衣原體門1%、TM7（1%）；變形菌、擬桿菌、厚壁菌、放線菌是優勢類群。其中裝甲菌門（Armatimonadetes）1%、衣原體門（Chlamydiae）1%、TM7（1%）、Thermi、綠彎菌門（Chloroflexi）在之前研究中未見報告；在屬（Genus）的水平上，占優勢的有浮霉狀菌屬（Planctomyces）、黃桿菌屬（Flavobacterium）、原綠球藻屬（Prochlorococcus）、新鞘脂菌屬（Novosphingobium）、Hydrocarboniphaga、氣微菌屬（Aeromicrobium）、紅長命菌屬（Rubrivivax）、Polynucleobacter、假單胞菌屬（Pseudomonas）、草酸桿菌屬（Oxalobacter）。 鄱陽湖最主要的微生物菌群的相對豐度上是有變化的，就各個採樣點而言所選取的採樣點之間未見微生物群落有顯著變化和顯著不同。而從鄱陽湖湖區的北部和南部來看，顯出了一種九月份微生物的豐富度呈現從北至南逐漸減少的趨勢，顯出了一種在八月份前後微生物的豐富度呈現從北至南逐漸增多的趨勢，這些趨勢與前面提到的單個採樣點呈現的微生物豐富度變化趨勢是一致的，初步推斷，鄱陽湖北部湖區與南部湖區的微生物豐富度呈現一種動態變化中，而八月至九月間很可能為這一動態變化趨勢呈現反轉變化的一個時間段。從群落結構上，可以推斷從2007年到2014年鄱陽湖湖泊水富營養化狀況趨於嚴重的情況的趨勢並沒有改變。PCA分析表明南磯鄉的樣品和吳城的樣品與星子、康山和梅溪採樣點的樣品比較差異性相對較大。
