《基於網路分析尋找前列腺癌相關microRNA生物標誌物》是依託蘇州大學，由沈百榮擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：基於網路分析尋找前列腺癌相關microRNA生物標誌物
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：沈百榮
- 依託單位：蘇州大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
2011年美國不推薦用前列腺特異性抗原篩查前列腺癌以來，尋找新型網路標誌物或非編碼RNA標誌物成為前列腺癌生物標誌物研究的熱點。但是什麼樣的基因、處在基因網路結構的什麼樣的位置，才可能成為前列腺癌的生物標誌物、並能套用於前列腺癌的診療？這樣的問題目前還沒有明確答案。 本項目旨在以前列腺癌為研究對象：(1)整合現有microRNA標誌物、建立microRNA標誌物資料庫,分析microRNA-mRNA/lncRNA網路結構、尋找作為標誌物microRNA的網路特徵；（2）將模型套用於前列腺癌、尋找前列腺癌的microRNA標誌物；(3)通過收集相關前列腺癌病人的組織樣本，驗證計算所發現的生物標誌物在不同分級的病人組織中的表達；尋找個性化的診斷標誌物；(3)結合生物信息學分析、系統模擬和分子生物學實驗,探討這些microRNA在前列腺癌發生、發展過程中的分子生物學功能，為將來的臨床套用提供依據。
結題摘要
項目背景：近年來精準醫學和個性化醫療的發展如火如荼，然而精準醫學的關鍵在與精準診斷，生物標誌物的發現如新藥發現一樣，每年FDA批准的新的生物標誌物越來越少，而且標記物的發現不如新藥發現，目前缺少基本的理論體系和模型，如何在基因組時代，充分利用各種組學數據、建立合理的模型，幫助迅速準確尋找分子標記物是目前急需解決的科學問題。 本項目主要研究內容包括三個方面：（1） 建立癌症相關的microRNA 標誌物資料庫；（2）利用此資料庫、尋找規律，建立癌症標記物發現的生物信息學理論與模型；（3）將此模型套用到前列腺癌和相關的癌症中，幫助尋找生物標誌物，並結合實驗加以驗證模型的準確性。 重要結果：通過項目的實施，我們建立了癌症相關的microRNA 標誌物資料庫，尋找到癌症相關的microRNA 標誌物的基本特徵，如獨立調控，重要的網路特徵和分子功能等，建立了基於證據的生物信息學模型幫助準確的尋找microRNA標誌物；並將此模型建立為公共軟體，加以推廣和套用。 關鍵數據是：我們建立了兩個指標用以衡量成為標記物的可能性，即單線調控的數目和靶點中轉錄因子的百分比等，這兩個特徵決定了miRNA分子所組成的子網路的脆弱性，具有脆弱性的網路結構是生物標誌物的主要特徵。 科學意義：（1）人類的分子網路具有一些基本特徵如：魯棒性、脆弱點，而這些網路結構往往與疾病發生髮展相關。（2）生物標記物的準確發現對於精準診斷和治療具有臨床套用價值。
