基於機率模型的基因晶片數據分析

基於機率模型的基因晶片數據分析

《基於機率模型的基因晶片數據分析》是依託南京航空航天大學,由劉學軍擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:基於機率模型的基因晶片數據分析
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:劉學軍
  • 依託單位:南京航空航天大學
  • 批准號:60703016
  • 申請代碼:F0214
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2008-01-01 至 2010-12-31
  • 支持經費:20(萬元) 
項目摘要
基因晶片技術是近十年來生命醫學研究中的一種重要工具,針對基因晶片數據的分析成為近年來生物信息學領域一個新興的研究熱點。針對晶片數據的高噪聲特性,本課題採用機率模型對廣泛使用的GeneChips晶片數據進行各個階段的分析處理。基於申請人先前研究基礎提出以下幾項研究:(1)改進自身先前提出的一個原始數據的機率分析模型multi-mgMOS,使其更加準確地估計基因表達水平的機率分布,並提高其計算速度;(2)運用尋找差異基因模型PPLR對該改進模型性能進行檢驗;(3)對基因表達數據聚類分析設計一個通用的聚類方法,考慮基因表達水平的機率分布,能夠對具有重複實驗的基因數據進行聚類,並且能夠在參數學習中自動確定聚類的最優類別數;(4)通過GeneChips晶片數據對該聚類方法進行性能論證。本研究將為基因晶片數據處理提供一系列高性能的機率模型,為分子水平上的功能基因組研究以及功能基因的發現提供有力幫助。

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