基因搜

基因搜

基因搜是國內擁有基因數最多、種屬最齊全的網路基因數據搜尋平台,用戶可以在這個平台上搜尋其所需的任意基因的信息。同時,為了豐富該庫的內容,該庫中還補充了部分載體庫、shRNA庫、microRNA庫、啟動子庫、細胞庫、抗體庫等生物資源,合稱七大生物資源庫。

基本介紹

  • 中文名:基因搜
  • 特點基因數最多、種屬最齊全
  • 分類:cDNA克隆庫、Vector庫等
  • 性質:網路基因數據搜尋平台
主要特點,詳細介紹,cDNA克隆庫,Vector庫,shRNA庫,MicroRNA庫,Cell庫,啟動子庫,如何選擇,cDNA還是ORF,BC還是NM,

主要特點

1、種屬齊全:人、小鼠、大鼠及其它大部分種屬;
2、數量眾多、內容豐富:包括收集了五萬多條cDNA的cDNA克隆庫、涵蓋了多個國外著名生物公司的兩百多種載體的Vector庫、shRNA干擾效率高達80%的shRNA庫、囊括了pre-miRNA和pri-miRNA的microRNA庫以及收藏了數百種細胞的Cell庫;
生物資源庫搜尋引擎生物資源庫搜尋引擎
3、檢索便利、信息全面:只要一個關鍵字或一個編號就可以直接檢索到所有相關信息,同時系統會自動進行篩選和排序,擇優最先顯示。突變少,序列正確率高。

詳細介紹

cDNA克隆庫

cDNA克隆庫是整合了國外數個cDNA庫資源後推出的一個功能強大、數據完善的cDNA克隆庫。該cDNA克隆庫收集了人類、大鼠和小鼠等種屬的五萬多條cDNA,且序列正確率高。

Vector庫

已有六百多種出自Promega、Stratagene、Clontech、Invitrogen、Ambion、Novagen、NEB等著名生物公司的載體,原核表達、真核表達、酵母雙雜交、報告載體、克隆載體等各種用途,所有載體均可提供測序報告(用載體上的通用引物測序),保證和官方提供的序列完全一致。

shRNA庫

TRC(RNAi協會)專業出品,針對人及小鼠近萬個基因,總數達五萬多條(每個基因3~5條shRNA)的shRNA庫。經過大規模實驗驗證,其中超過90%均為有效shRNA,其干擾效率均大於80%(大多數超過90%)。

MicroRNA庫

既有pre-miRNA庫,也有pri-miRNA庫。其中pre-miRNA庫較全,擁有近四百個已經發現的pre-miRNA形式的microRNA。pri-miRNA庫中的microRNA數量稍少。

Cell庫

該庫中收藏了數百種細胞的全部信息,其中以目前最熱門的腫瘤細胞為主,主要是針對生物醫學領域而設定的。

啟動子庫

啟動子庫有380多種常用啟動子,包括廣譜表達型啟動子、組織特異性啟動子、腫瘤特異性啟動子、定製啟動子等多種形式。

如何選擇

cDNA還是ORF

cDNA克隆ORF克隆
非表達型
表達型
非表達型
表達型
表達型(+大提)
常見載體
pOTB7
pCMV-SPOT6
pUC57
自選
自選
產品特點
全長序列,含有5’和3’ UTR
載體多為克隆載體
無表達框,保證CDS區序列正確,同NCBI
全長序列,含有5’和3’ UTR
基因片段位於表達框中,CMV啟動子調控
保證CDS區序列正確,同NCBI
基因ORF序列
Kozak序列,增強基因表達
兩側有合適酶切位點,便於後續亞克隆操作
完全測序,保證序列正確,提供測序報告
詳細的構建報告
基因ORF序列
Kozak序列,增強基因表達
載體自選,多種載體多種標籤可選
可直接用於蛋白表達
完全測序,保證序列正確,提供測序報告
詳細的構建報告
基因ORF序列
Kozak序列,增強基因表達
載體自選,多種載體多種標籤可選
可直接用於蛋白表達
完全測序,保證序列正確,提供測序報告
詳細的構建報告
提供轉染級大提質粒,可直接用於細胞轉染
產品不足
客戶需自己做基因克隆實驗
後續實驗繁瑣,且可能會出錯,無法獲得滿意的基因表達載體
費時費力
雖可直接用於表達,但是5’ UTR序列可能會形成複雜二級結構,影響基因的表達效率
無法用於蛋白表達,需通過基因克隆裝載至合適的表達載體
小提質粒,無論是純度還是濃度都不適合用於細胞轉染
客戶需自己做質粒大提

BC還是NM

  • 經費充足時,建議選NM_xxxxxx
  • BCxxxxxx和NM_xxxxxx兩者CDS區相同時,可以選BCxxxxxx
  • BCxxxxxx和NM_xxxxxx兩者CDS區不同時,以NM_xxxxxx為準
小鼠和大鼠基因通常只有BCxxxxxx的克隆產品
BCxxxxxxNM_xxxxxx
NIH-MGC Project產品
序列、載體等信息均完全同NCBI
序列同cDNA而不是同genome,與NM_xxxxxx序列有時候存在差別
大部分克隆的CDS區序列同NM_xxxxxx
價格通常比NM_xxxxxx便宜

相關詞條

熱門詞條

聯絡我們