國家地理信息系統工程技術研究中心深圳基地於2010年11月在第十二屆深圳高交會期間設立，選址中國地質大學深圳產學研基地，占地面積7202平方米，建築面積25000多平方米。成立至今，得到了深圳市政府和GIS產業聯盟的大力支持。國家地理信息系統工程技術研究中心深圳基地以中地數碼集團自主研發的MapGIS國產軟體平台為技術支撐，致力於打造深圳市GIS領域的公共技術服務平台；以深圳市空間信息技術產業園建設為核心，不斷推動GIS領域的技術創新和科技成果轉化。
國家地理信息系統工程技術研究中心深圳基地現有人員59人，其中研發人員31人，均為大學本科及以上學歷。經過近幾年的發展，深圳基地堅持貫徹GIS產業聯盟技術創新的任務和目標，積極打造深圳市GIS領域的公共技術服務平台，充分發揮聯盟的行業技術創新的引領和支撐作用。
深圳市空間信息技術產業園作為深圳基地的主體園區，截至目前園區入駐企業45家，高新技術企業16家，累計畢業企業14家，企業員工總數2000多人，其中90%以上的人員均具有本科及以上學歷，接受孵化載體專業培訓人數為10人。近五年園區企業累計總產值達70.54億元，累計淨利潤11.21億元，累計納稅總額6.23億元，擁有自主智慧財產權86項，有力推動了地理信息技術成果轉化和產業輻射，為國家地理信息系統工程技術研究中心深圳基地的建設與發展奠定了堅實的基礎。
國家地理信息系統工程技術研究中心深圳基地建立了產學研結合的有效機制，積極承擔深圳市政府重大技術創新任務；整合資源、為中小企業服務構建產業技術創新平台；積極落實國家自主創新政策，發揮深圳基地行業技術創新的引領和支撐作用。深圳基地以“凝聚科技資源、引領技術創新、支撐產業發展”為宗旨，以加快建立完善創新體系，突破地理信息領域關鍵和共性技術問題為核心，以建立技術標準，培養人才，提升產業核心競爭力為目標，積極促進地理信息產業在深圳的發展。
