單鏈酶法

單鏈酶法: 鹼基GC 配對之間有三個氫鍵，比AT 配對的穩定性高。當用加熱或其他變性試劑處理DNA 時，雙鏈上AT 配對較多的部位先變成單鏈，套用單鏈特異的S1核酸酶切除單鏈，再經氯化銫超速離心，獲得無單鏈切口的DNA。

用酶法區別單鏈DNA與雙鏈DNA

大部分DNA以雙螺旋結構存在，但一經熱或鹼處理就會變為單鏈狀態。單鏈DNA在分子流體力學性質、吸收光譜、鹼基反應性質等方面都和雙鏈DNA不同。某些噬菌體粒子內含有單鏈環狀的DNA，這樣的噬菌體DNA在細胞內增殖時則形成雙鏈DNA。