單核苷酸多樣性(single nucleotide polymorphism，SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多樣性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種。占所有已知多樣性的90%以上。SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每500~1000個鹼基對中就有1個，估計其總數可達300萬個甚至更多。
理論上講，SNP既可能是二等位多態性，也可能是3個或4個等位多態性，但實際上，後兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態性的。這種變異可能是轉換(C←→T，在其互補鏈上則為G←→A)，也可能是顛換(C←→A，G←→T，C←→G，A←→T)。轉換的發生率總是明顯高於其它幾種變異，具有轉換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點
