《啟動子區域遺傳多態性位點與骨質疏鬆關在線上制研究》是依託蘇州大學,由雷署豐擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:啟動子區域遺傳多態性位點與骨質疏鬆關在線上制研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:雷署豐
- 依託單位:蘇州大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
骨質疏鬆(OP)是我國面臨的日益嚴重的健康問題。OP 受複雜的遺傳調控,.但目前絕大多數遺傳因子並未被鑑定。啟動子區域是基因調控的關鍵元件之一。申請者前期研究發現大量啟動子區域的遺傳多態性位點與骨質疏鬆關聯。本項目擬選取前50 個與椎骨骨密度(BMD)有顯著關聯信號的單核苷酸多態性(SNP),並在一個具有5,000 健康個體的獨立大樣本中,驗證這50 個SNP 與骨質疏鬆表型的是否具重複關聯信號;對有重複關聯信號的SNP 進行SNP生物學功能預測;並經凝膠電泳遷移率實驗、螢光素酶表達實驗、等位基因特異的mRNA 和蛋白質表達等實驗,探討SNP 與表型關聯的功能機制,從而清晰闡明啟動區域的遺傳變異位點決定骨質疏鬆的複雜機制。本研究可進一步闡明和理解骨質疏鬆症的遺傳致病機理,為骨質疏鬆症的早期預測、預警和診斷以及尋找新的藥物設計靶點提供新的思路和理論依據。
結題摘要
骨質疏鬆(OP)是我國面臨的日益嚴重的健康問題。OP 受複雜的遺傳調控,但目前絕大多數遺傳因子並未被鑑定。以前的研究表明遺傳多態性位點與骨質疏鬆存在關聯,但是其關聯的功能機制未明。遺傳多態性位點存在於基因的不同位置,所以會存在不同的功能機制。本項目選取了存在於啟動子區域、miRNA靶基因結合區域以及磷酸化位點區域的幾個代表性遺傳位點,探討了這些SNP 與表型關聯的功能機制。通過eQTL分析、meta分析以及螢光素酶差異表達分析,發現OPG基因啟動子區域的rs2073617能調控OPG基因的表達,不同基因型的個體存在該基因的表達差異。通過螢光素酶差異表達分析、等位基因差異表達實驗等發現wnt2B基因的3’UTR區域中的rs2273368多態性位點,通過結合miR-411-5P影響進而在轉錄後水平調控該基因的差異表達。通過磷酸化水平檢測、ALP檢測、鈣結節染色、RT-PCR等實驗,發現C17orf53基因的SNP rs227584的不同等位基因質粒會影響細胞的總磷酸化水平,影響相應位點對蛋白磷酸化、並對成骨細胞分化有調節作用,從而最終影響骨密度。本項目培養了碩士生10名和博士生5名。該項目研究成果已在國際和國內的權威雜誌上發表SCI論文總計15篇。該項目探討SNP 與表型關聯的功能機制,從而闡明遺傳變異位點決定骨質疏鬆的複雜機制。本研究可進一步闡明和理解骨質疏鬆症的遺傳致病機理,為骨質疏鬆症的早期預測、預警和診斷以及尋找新的藥物設計靶點提供新的思路和理論依據。