《哺乳動物細胞遺傳相互作用網路的高通量構建方法》是依託清華大學，由謝震擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：哺乳動物細胞遺傳相互作用網路的高通量構建方法
- 依託單位：清華大學
- 項目負責人：謝震
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
遺傳相互作用是指基因間的功能關係，可以通過研究單個基因沉默後的表型與組合基因沉默後的表型差異來確定。研究哺乳動物細胞中分子網路節點間的遺傳相互作用，將對闡述哺乳動物細胞的生命現象，發現疾病發病機制和尋找治療方案等提供重要依據。然而，採用高通量的基因表達沉默技術，在哺乳動物細胞中研究雙基因遺傳相互作用的方法還處在探索初期，並且目前還沒有研究多基因遺傳相互作用的高通量方法。本項目將針對這一國際前沿問題，建立基於CRISPR/Cas技術的雙基因敲除文庫構建和表型觀測高通量實驗方法；研究利用合成microRNA簇敲低多個基因的可行性，建立microRNA簇文庫的快速組裝和多基因敲低的表型觀測方法；探索基於雙基因敲除和多基因敲低技術構建遺傳相互作用網路的計算分析方法。本項目的順利進行，將大大提高哺乳動物細胞遺傳相互作用網路研究的效率，並將為功能冗餘基因間相互作用的研究提供高效實驗和分析方法。
結題摘要
研究哺乳動物細胞中分子網路節點間的功能相互作用，將對闡述哺乳動物細胞的生命現象，發現疾病發病機制和尋找治療方案等提供重要依據。本課題建立了CRISPR/Cas雙gRNA文庫的構建方法和功能篩選方法，研究了黑色素瘤對威羅菲尼耐藥性和與結直腸炎症向腫瘤發生過程有關的遺傳相互作用網路。我們還建立了microRNA簇的快速組裝合成方法和細胞功能篩選方法。此外，我們還建立了一套高通量雙敲除和多敲低數據的生物信息學分析流程.本課題的研究方法將為後續哺乳動物細胞的遺傳相互作用網路研究提供了高效工具和參考。
