呼和浩特金融仲裁院主要受理金融機構之間或金融機構與企事業法人、其他組織、自然人之間在金融交易、金融服務等活動中發生的民商事爭議糾紛而提出的仲裁申請，仲裁範圍包括存款和借款糾紛、擔保糾紛、理財糾紛、支付結算糾紛、保險糾紛、證券糾紛、期貨糾紛、外匯和黃金交易糾紛、融資租賃糾紛、信託糾紛、保理和代付糾紛、典當糾紛及金融衍生品糾紛等方方面面。
呼和浩特金融仲裁院擁有金融、法律等專業資深專家仲裁員416餘人，其中金融專家58人。聘用的首批仲裁員將是長期從事金融實踐工作的金融界專業人士、長期從事金融法律服務的律師、或者是高等院校及研究機構長期從事金融學術和法律研究的學者、教授，金融審判經驗退休資深法官擔任。仲裁實行一裁終局的制度，仲裁判決與法院判決具有同等法律效率。
