同源三倍體水稻基因組DNA甲基化研究

《同源三倍體水稻基因組DNA甲基化研究》是吳先軍為項目負責人,四川農業大學為依託單位的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:同源三倍體水稻基因組DNA甲基化研究
  • 項目類別 :面上項目
  • 項目負責人 :吳先軍
  • 依託單位 :四川農業大學
科研成果,項目摘要,

科研成果

序號
標題
類型
作者
1
兩種基因組甲基圖譜構建技術評介
期刊論文
彭海|張靜|
2
雙胚苗水稻來源的單倍體、二倍體及其雜交F1的DNA甲基化位點分析
期刊論文
吳紹華|張紅宇|薛晶晶|徐培洲|吳先軍|
3
擬南芥的印記基因和印記表達調控
期刊論文
張紅宇|徐培洲|楊華|吳先軍|
4
雙胚苗水稻單倍體及其雜交後代基因組DNA甲基化特異位點的分析及功能探討
期刊論文
吳紹華|薛晶晶|張紅宇|徐培洲|吳先軍|
5
脅迫條件下植物DNA甲基化的穩定性
期刊論文
彭海|席婷|張靜|吳先軍|
6
Special DNA Methylated Sites Between Haploid of Twin-Seedling and Its Hybrids in Rice (Oryza sativa)
期刊論文
WU Shao-hua|XUE Jing-jing|ZHANG Hong-yu|XU Pei-zhou|WU Xian-jun|

項目摘要

多倍化是植物進化的重要方式,多倍化後DNA甲基化修飾變異調控多倍體基因表達,進而影響進化的歷程。過去對多倍體甲基化研究多針對個別基因,沒有多倍體全基因組DNA甲基化修飾圖譜的報導,無法在基因組水平上詳細分析DNA甲基化對多倍體基因表達與進化的影響。本項目擬採用來自水稻雙胚苗中遺傳背景相同,僅具倍性差異的同源三倍體與對應二倍體為材料,按DNA甲基免疫沉澱與tiling晶片雜交相結合的技術方案(ChIPchip),建立水稻同源三倍體全基因組高解析度甲基化變異圖譜。在基因組水平上,詳細分析多倍化後DNA甲基化修飾變化;分析DNA甲基化對多倍體染色質結構的影響;結合已有編碼基因和小RNA表達資料,探討多倍體DNA甲基化對基因表達的調控機理,並通過亞硫酸鹽測序和實時PCR進行驗證。項目研究結果將為植物多倍體進化中表觀遺傳調控機制的揭示奠定基礎。

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