合肥市西南部生態補水管理中心是合肥市水務局直屬單位。
（一）工程管理。負責西南部生態補水直管工程及渠道的日常管理、維修和養護工作；承擔西南部生態補水直管工程運行安全管理工作；協調指導調度工程的運行安全管理工作；參與西南部生態補水工程範圍內相關防洪及工程建設方案擬定、審查、實施工作。
（二）防洪保全。負責西南部生態補水直管渠道、小（一）型水庫防洪和配合總乾渠分洪工作；負責指導轄區內的5座小（二）型水庫防洪工作；負責並協調西南部生態補水工程區域內雨洪水調度、排澇工作。
（三）水資源調度。承擔組織擬訂並實施西南部生態補水年度水量分配、調度計畫及應急水量調度預案的具體工作；參與西南部生態補水工程沿線水污染防治和突發性水污染事故的處理工作；負責對“一渠（大蜀山分乾渠）、六庫（王嘴湖、柏堰湖、天鵝湖、翡翠湖、南艷湖、青年壩水庫）、三河（十五里河、塘西河、上派河）、兩濕地（十五里河、塘西河濕地）”水質日常檢測、預報及補水的水量配置、區域協調工作；負責生態補水和農業灌溉水費的徵收工作。
（四）水行政執法。負責宣傳、貫徹水法規；依法對水事活動進行監督檢查；對違反水法規的行為作出行政裁定、行政處罰和其他行政處置措施；負責實施取水許可證制度；配合公安、司法機關依法查處水事違法案件。
（五）農業灌溉。負責承擔肥西縣桃花鎮、桃花工業園、高新區柏堰科技園、蜀山區小廟鎮、南崗鎮和高新區部分農業灌溉任務31041.12畝。
（六）承辦市水務局交辦的其他事項。
