台州學院腫瘤研究所（原台州學院醫學細胞生物學研究所）是醫學院科學研究的主要場所，此外還承擔著各專業的細胞分子生物學、分子生物學檢驗技術、醫學遺傳學實驗等課程的實驗教學任務。現任所長姚軍博士。
研究所主要研究方向有5個：腫瘤與細胞信號轉導、腫瘤的蛋白質組學、基因多態性與疾病的相關性、病毒基因疫苗、微生物耐藥基因和機理等。
所長姚軍博士為浙江省高校中青年學科帶頭人，台州市211人才（第二層次）。目前，對消化系統腫瘤的細胞信號轉導及蛋白質組學研究水平處於國內領先水平。該所現有在編成員7人，其中教授1人，副教授4人，博士6人。腫瘤研究所是浙江省高校重點建設學科,近年來，該所先後承擔各層次的科研項目三十餘項，包括科技部重大傳染病專項(子課題)、國家自然科學基金、浙江省自然科學基金等項目。研究所成員以第一作者或通訊作者共發表SCI收錄的論文三十餘篇。
台州學院腫瘤研究所將繼續加強科研平台的軟硬體建設；積極開展腫瘤學臨床研究和基礎研究，面向甲狀腺、乳腺、消化道腫瘤開展學科協作研究，努力獲得高水平的原創性學術成果；積極培養優秀的腫瘤學科研和臨床醫務人員；積極拓寬國內、國際合作平台和渠道開展國內外學術交流，為套用性創新人才培養提供更好的條件；努力建成省級重點實驗室，達到建成腫瘤學專業碩士點的所有指標要求。
