江蘇省南通地方稅務局成立於1994年9月12日,原名南通市地方稅務局,目前下轄啟東、海門、通州、如東、如皋、海安等6個縣(市、區)局和市區5個稅務分局、1個涉外分局、1個稽查局。主要負責南通地區地稅部門徵收的各種稅種、教育費附加及政府規定或者委託的基金、費等專項收入的徵收管理工作。全系統現有幹部職工1594人,平均年齡41.36歲,40歲以下占47.6%;在職幹部大專以上學歷1463人,其中:研究生學歷占比6.7%,本科以上學歷占比87.6%;擁有中級以上職稱者占比56.3%;擁有“三師”等執業資格者占比10%。自組建以來,南通地稅系統連年超額完成各項收入任務,年收入總量從2000年的19.28億元上升到2010年的315.56億元。 “十一五”期間,全市地稅系統累計組織收入1005.5億元,年均增長27%以上,增幅高出全省平均水平6.8個百分點,列沿江八市之首;地稅收入占全市一般預算收入的比重從“十一五”期初的48%上升到期末的54.2%,為南通市財政收入穩定增長和經濟社會發展奠定了堅實基礎。
2018年7月5日,原南通市國家稅務局、南通地方稅務局正式合併組建為國家稅務總局南通市稅務局。