南海海洋科學資料庫的建設是基於國內外對中國南海及其鄰近海域科學考察和各種觀測取得的各種海洋數據， 經過處理而獲得的各種數據產品，採用現代資料庫和網路信息技術，建立起南海海洋科學數據共享平台。南海海洋科學資料庫主要套用于海洋科學研究、國家和地方政府決策以及國防對南海海洋科學信息的需求， 主要服務對象為海洋科研人員、國家和地方的決策部門。隨著海洋經濟發展對於各種海洋信息量需求的增加， 資料庫將直接服務於國家建設和國家安全，同時滿足社會各界對於南海海洋信息的需求。
南海海洋科學資料庫主要組成:
1、南海物理海洋資料庫
2、南海海洋化學資料庫
3、南海海洋生物資料庫
4、南海海洋地質資料庫
5、南海地球物理資料庫
6、南海航次資料資料庫
7、西南沙台站資料庫
8、南海數據產品圖集庫
9、南海遙感產品圖集庫
10、南海海洋元資料庫
