南平市人民政府口岸辦公室掛靠在市外經貿局，負責檢查、監督口岸各單位按各自職責的規定，對出入境人員、交通工具、貨物和行李物品進行監督，管理及檢查、檢驗、檢疫；負責主持平衡全市口岸的外貿運輸、集運、疏運計畫，並姑經本市口岸進出口的外貿貨物進行統計和綜合分析；開展對口岸單位職工的政策、法規教育，協同有關部門對重大涉外問題和嚴重違反口岸紀律問題進行查處。
