目前已建成的南醫大蘇北臨床醫學研究院占地八千餘平方米，包括占地五千餘平方米的中心實驗室、基因測序平台、生物樣本庫、占地四百平方米實驗動物中心和國家藥物臨床試驗中心。
2017年12月27日，南京醫科大學蘇北臨床醫學研究院揭牌儀式在附屬淮安第一醫院舉行。校領導沈洪兵、徐珊，淮安市政府代市長蔡麗新、副市長王紅紅，及校府雙方相關職能部門負責人、研究院首屆理事會和學術委員會有關成員、淮安市直醫院負責人、淮安市臨床重點專科學科帶頭人參加。儀式由淮安市政府副市長王紅紅主持。
儀式上，淮安市政協副主席、附屬淮安第一醫院黨委書記、院長孫曉陽介紹了研究院籌建概況，徐珊副校長宣讀了《關於成立南京醫科大學蘇北臨床醫學研究院首屆理事會和學術委員會的通知》，淮安市衛生和計畫生育委員會主任、研究院理事代表孫邦貴做了主題發言，沈洪兵校長與蔡麗新市長共同為研究院揭牌。
蔡麗新市長在講話中強調，南京醫科大學蘇北臨床醫學研究院在淮安落戶安家，是淮安衛生科技發展史上的一件大事，它通過校府合作模式，搭建集智攻關和成果轉化的科技平台，必將推動淮安市科技工作在淮安常見病、多發病研究領域及臨床套用上取得更大更多的突破，對於推進健康淮安建設，打造醫在淮安品牌，增進百姓健康福祉具有重要意義。
沈洪兵校長指出，研究院的成立開創了學校與地方政府合作的新模式，是校府合作的大膽探索和有益嘗試。他回顧了近三十年來學校與淮安市的合作及取得的成果，提出我校在高水平大學建設的進程中，與淮安社會經濟互為支撐、共贏發展，在更高的起點重新定位、全面規劃、大力推進新一輪高層次、高質量的校府合作尤為重要。他要求蘇北臨床醫學研究院在新的平台上，拿出新思路、新舉措，開展新合作，攜手共創醫學人才培養、醫學研究和醫療衛生服務的新局面，為健康中國、健康江蘇建設作出更大貢獻。
