北京市協調推進新機場建設工作辦公室是北京市發改委直屬單位。秘書處：負責文電、會務、機要、檔案等日常運轉工作；承擔信息、接待聯絡工作；承擔重要事項的組織落實和督查工作。投資計畫處：負責協調製定北京新機場及外圍配套工程本市投資政策；協助推進北京新機場前期工作；負責聯繫北京新機場建設國家機構。綜合協調處：負責協調推進北京新機場建設征地拆遷、外圍交通及配套工程規劃建設工作；負責主體工程建設的協調配合與銜接工作；負責協調南苑機場現址利用規劃編制和新址建設相關工作。
