公共組織橫向結構，是指公共組織的橫向分層，即各級人民政府在管轄範圍內依法設定地位一致、職能不同的若干工作部門的職能式結構。不同層級的人民政府，其所設定的部門各不相同。國務院設定部、委、辦; 省級人民政府設定廳、委、局、辦; 縣級人民政府設定局、委、辦、科等。如2003 年我國國務院機構改革後，國務院組成部門有28 個，如國家人口和計畫生育委員會、國務院國有資產監督管理委員會、中國銀行業監督管理委員會、商務部、外交部、國防部、教育部、科學技術部、國防科學技術工業委員會、國家民族事務委員會、公安部、國家安全部。
公共組織縱向結構，是指公共組織的縱向分層，即各級政府上下級之間、各級政府組成部門的上下級之間所存在領導與被領導關係的等級模式。縱向結構體現公共組織之間的命令服從關係、報告關係和隸屬關係。欲完善公共組織的縱向結構，有必要處理好管理層次和管理幅度之間的關係。依照相關法規，當前我國公共組織縱向結構分為五級:一是中央人民政府，即國務院;二是省、自治區、直轄市、特別行政區; 三是自治州、設區的市(地區、盟); 四是縣、自治縣、不設區的市(旗、自治旗)、市轄區; 五是鄉、民族鄉、鎮。
