內蒙古自治區環境監察局（掛內蒙古自治區環境應急中心牌子）為自治區環境保護廳所屬的相當於正處級事業單位。其主要職責任務是：依法對轄區內執行環境保護法律法規情況和環境治理項目進行監督檢查，對排污費的徵收進行監督檢查，對下級環境行政執法進行稽查；依法對跨省、區環境污染事故和生態破壞事件進行調查取證；對自治區境內重大環境污染事故（糾紛）、生態破壞事件進行調查處理；參與核安全設施和自然生態保護、農業生態環境保護監督檢查；承擔自治區環保廳環境應急指揮領導小組辦公室日常工作，承擔重、特大突發環境污染事故和生態破壞事件的應急處理工作；承辦轄區內12369環保舉報投訴受理和國家環保部應急與事故調查中心網上投訴轉辦等工作。
